1.朱晓莉（1/1）《薏苡仁酯联合化疗治疗非小细胞肺癌的临床研究》，江苏省卫生厅科技发展基金会科研优秀项目（江苏省卫生厅科教处、江苏省医学会肿瘤化疗与生物治疗分会），优秀项目，2013（朱晓莉）
2.朱晓莉（1/1）《南京市第九届自然科学优秀学术论文奖》；题目：非小细胞肺癌患者XPC基因Lys939Gln多态性与铂类药物为主化疗疗效相关； 南京市自然科学优秀学术论文评审委员会，2011（朱晓莉）
3.朱晓莉（1/1）《南京市第九届自然科学优秀学术论文奖》；题目：藤黄酸诱导非小细胞肺癌细胞凋亡的机制及其与转铁蛋白受体的关系；南京市自然科学优秀学术论文评审委员会，2011（朱晓莉）
4.朱晓莉（8/15）孤立性肺结节的螺旋CT动态增强研究》省级成果（苏科鉴字2004第777号）；江苏省科技厅，科技进步三等奖，2005（储成凤、徐秋贞、刘斌、杨明、陈峰、姚青、张俭、朱晓莉、朱亚彬、杨小庆、郏爱明、方丽、秦伟、陈龙桂、藤皋军）
5.朱晓莉（5/7）《雷公藤多甙对哮喘IL-5、ICAM-1及其mRNA表达的影响》省级成果 （苏科鉴字2003第772号）,南通市科技局，科技进步二等奖，2005（张祖贻、王西华、杨远、金淑贤、朱晓莉、骆益民、尹静萍）
6.朱晓莉（3/3），《支气管肺泡灌洗液CEA、β2-MG测定对肺癌诊断的临床应用》省级成果（95苏卫鉴字23号）；铁道部，科技进步四等奖，1996（张祖贻，刘璐，朱晓莉）
7.朱晓莉（4/7）《联合测定胸水LDH、LZM、ADA鉴别良恶性胸水的临床研究》 省级成果（95苏卫鉴字31号）；江苏省卫生厅，1995（李基业、张祖贻、骆益民、朱晓莉、林勇、赖启明、周贤梅）